Больничный оплатит ФСС. Работник пишет заявление, а работодатель направляет в ФСС реестр. Образец заявления можно найти на сайте Краснодарского регионального отделения Фонда социального страхования в разделе «Прямые выплаты/Формы документов» (kubanfss.ru).